鱼类的杂交育种已经成为普遍现象，许多杂交培育出的新品种的鱼类颜色亮丽，体态各异，受到广大鱼友的喜爱。杂交育种最重大的意义就在于增加生物变异，可以使一个群体的基因转移到另一个群体，如果子代继承了父母不同的优良基因，则会使非常强悍的新一代。但如果继承了双亲的劣势基因，产生的子代则成了悲剧的物种。
杂交培育新品种最典型的当然是金鱼了，但是热带鱼中也有很多品种都是杂交出来的，其中最典型最具代表性的当属鹦鹉鱼跟罗汉鱼了。
一、鹦鹉鱼。
鹦鹉鱼，因其色彩艳丽，体型漂亮而被广大鱼友喜欢。但是鹦鹉鱼原产台湾，是由红魔*和紫红火口鱼杂交而成。据说是台湾的蔡建发偶然将红魔*和紫红火口杂交得到，最开始还是商业机密，直到后期才公开。
但由于鹦鹉鱼是不同品种间的杂交种，所以雄性血鹦鹉是不具备生殖能力的。鱼卵的染色体也就无法整齐配对，所以胚胎不能发育成为仔鱼。
二、罗汉鱼。
我们熟悉的罗汉鱼也是杂交出来的品种，是由水族业者经过不断的杂交选育，才培育出一种全新的鱼种，并引发一鼓养殖罗汉鱼的热潮。罗汉鱼主要由青金虎（Cichlasomatrimaculatus）、紫红火口（Cichlasomasynapilum）、九间波罗（Cichlasomanigrofasciatum）、金钱豹（Cichlasomaacrpinte）和金刚鹦鹉、红魔*等等通过复杂的杂交过程，才配出我们现在所看到的英伟雄壮的罗汉鱼，但罗汉鱼的育种仍属于一门非常新的学问，各繁殖场都将亲鱼的来源视为最高机密，因此在鱼种的亲代来源上我们只能推断，而不能确定。
杂交出的优良子代自然有明显的优势，比如生长速度快、繁殖能力强，抗病性强等等。一般而言，差异较大的双亲培育出的子代能够继承父母的双重优质，但如果子代继续进行杂交，培育出的第三代、第四代，很可能是一代不如一代。
虽然我们现在看到的培育出来的成品都很漂亮，但杂交出现的失误远远大于成功。比如鹦鹉鱼似乎是受到鱼友的喜爱，但公鹦鹉鱼没有繁殖能力，这其实是一种残疾。再比如罗汉鱼的额珠，也是杂交形成，从观赏性来说也许是有所价值，但对鱼类而言，未尝不是一种基因突变导致的畸形。